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一张神图,解决科研统计80%的问题。

果子 果子学生信 2023-06-15

我的统计学一直就是稀里糊涂的状态。
大部分情况都是用的t检验,
所有分析都只看得懂p值。

所以,我买了很多统计学的书籍,一本接一本,有很多都没拆封,看不下去。
而我,则没有任何焦虑,静静等待神奇时刻的出现。

这种神奇时刻,曾经在我的生命中,出现多次。
比如,大学看到了这一句

人与人之间的相处,本质上是资源的互换。

从那之后,我做的所有事情,都是在积累资源,我要成为一个能跟别人互换资源的人。这种资源,可以是一个技能,也可以是一件物品,或者是钱财。

又比如,财务思维课里的这句:

花出去的钱,如果能赚钱,那就不叫消费,属于资产。

那以后,买书简直如山倒,因为我不再追求看完,而是对自己说:

如果一本50块钱的书,里面的任何一句话,让我赚回了50块钱,那么这本书就是白捡的。

买其他东西的时候也是一样,如果是刚需,再贵也得买。

学习R语言也是一样,徘徊两三年没有学会,但是因为要去培训,一个月每天10小时,最终入门了,这其中,tidyverse这个包 起到了很大作用,所以我称他为神包。

而对于让人懵圈的统计,我也是在等待,终于,这一周让我碰到了一张神图,他的出现让我觉得,统计学可以入门了。

这张图的原始链接在这里
http://blog.sciencenet.cn/blog-651374-985834.html

我在科研中用到统计学,80%的情况都是比较差异。而这张图中给出了多组数据求差异的流程图,我看过后,那些以前的只言片语,零星记忆都串联在了一起。
1.我们手上的数据,要首先判断是否是正态分布,方差齐不齐
2.假如是正态分布,而且方差齐,就用参数检验,此时要看究竟有几组数据
3.如果是两组,这种情况很常见,就用t检验
4.如果多组,比如基因在癌症中四个亚型中表达,要用方差分析
5.如果没有差异就算了,如果有差异,还要进行事后检验( post-hoc test )
6.事后检验有多种需求,如果是4组,理论上两两比较需要6次,假如我以其中一个作为对照只要3次,这两种情况用的统计方法也不一样。
7.假如一开始数据不是正态分布,或者方差不齐,那么可以用数据变换的方式把数据变成正态方差齐性数据,也可以用非参数检验。
8.如果数据只有两组,用Mann-Whitney U test,这个才文章中比较常见。
9.如果是多组,要用到Kruskal-walls检验,如果有差异,也需要进行事后检验( post-hoc test ),而且也有一系列方法可供选择。

这样,框架就搭建起来了,这张图里面,看不懂的检验名称去检索一下就可以。
要理解这个框架,我有一个教程推荐,是协和八公众号出的,60篇帖子,写了三年,十分适合此刻的我,虽然我已经看了四年,但是都抵不上看了神图后理解的快。
链接在这里:
说人话的统计学——终点·起点 | 协和八

接下来,我要做的事情,就是用R语言完成里面提到的所有统计分析,而统计是R语言的看家本领啊。
在这方面,我有两本参考书籍,都是用R语言帮助科研工作者理解统计学的免费教程。
An R Companion for the Handbook of Biological Statistics
https://rcompanion.org/rcompanion/index.html
还有一本
Learning statistics with R
https://learningstatisticswithr.com/book/

要强调一句的是,每个人的学习习惯都不一样,如果你觉得这个图平淡无奇,欢迎给我展示,我会把他们分享给公众号的读者。

如果你像我一样,在过去的学习生活中,被一些神奇时刻醍醐灌顶过,欢迎在留言区给我分享,我会把大家的留言集合起来做个众创帖子,名字都已经想好了,果子和他的朋友们的神奇时刻。
在留言区留言献计的朋友(截止日期8月11号晚上12点),我们会用R语言中的函数sample随机产生一位幸运观众(最终方法由果子决定,保证公平公正),将获得由微基因提供的检测试剂盒一个,价值499元,是我参加珠海生信会议获得的,我已经检测过,所以就当礼品拿出来分享。

以下是微基因检测的官方说明(我们公众号跟他们没有利益关系);

只需 1mL 唾液,您就可以轻松在家获取个人基因检测报告,包含祖源、运动、营养、美肤、健康、心理等 9 大类,官方解读约 200 项报告(具体报告数以实际检测为准),提供 PDF 版报告且承诺终身免费更新。

而我的结果里面,老年痴呆的风险比较大,智商平平。所以, 承受不了这种信息的朋友,如果中奖了,可以考虑转手。而我现在却很平静:

我花了20几年,最终发现自己是个普通人,在人群中并不会自带光芒。接受了自己的平庸后,心里反倒是很轻松平静,普通人也有普通人的活法和幸福。

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