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2024年张锋团队迎来首篇Cell
Fanzor (Fz)是一种广泛存在于真核生物结构域的ωRNA引导内切酶，具有独特的基因编辑潜力。
2024年8月28日，麻省理工学院/博德研究所张锋团队在Cell在线发表题为“Structural insights into the diversity and DNA cleavage mechanism of Fanzor”的研究论文，该研究描述了来自三种不同生物的Fzs的结构。
研究发现，无论ωRNA的长度如何，Fzs都有一个共同的ωRNA交互界面，这在物种之间差异很大。该研究还揭示了Fz的DNA识别模式和解绕能力以及非规范催化位点的存在。这些结构展示了Fz的蛋白质构象如何移动，以允许双链DNA结合到R环内的活性位点。在机制上，不同状态下的结构检测表明RuvC结构域上的盖子环的构象受向导/DNA异双工的形成控制，调节核酸酶的激活和DNA双链在单切割位点的位移。
另外，2024年8月6日，博德研究所张锋团队在Molecular Cell 在线发表题为”Structural determinants of DNA cleavage by a CRISPR HNH-Cascade system“的研究论文，该研究描述了Selenomonas sp. HNH-Cascade (SsCascade)与靶DNA复合物的冷冻电镜结构，并表征了其作用机制。级联支架由HNH结构域补充，形成一个环状结构，其中未缠绕的目标DNA被精确地切割。这种结构可视化了两个可扩展生物系统的独特混合-cascade，可编程DNA效应物的进化平台，和HNH核酸酶，具有酶活性谱的自适应结构域（点击阅读）。
2024年6月11日，哈佛医学院/麻省理工学院/博德研究所张锋等团队合作在Mobile DNA在线发表题为“Internal initiation of reverse transcription in a Penelope-like retrotransposon”的研究论文，该研究利用从大肠杆菌中纯化的蛋白质，报道了从青色变色蜥(Anolis carolinensis)中提取的PLE的独特体外特性，揭示了其他逆转录转座子所不具有的机制方面。该研究发现逆转录是在转座子RNA的两个相邻位点上启动的，这两个位点与被切割的DNA不同源，这一特征反映在基因组的“尾巴”特征中，这是PLE之间共有的和独特的。该研究首次在体外激活了PLE，为理解PLE的动员和生物学提供了一个起点。
2024年5月29日，东京大学Osamu Nureki及博德研究所张锋等团队合作在Nature 在线发表题为“Structural basis for pegRNA-guided reverse transcription by a prime editor”的研究论文，该研究展示了SpCas9-M-MLV RTΔRNaseH-pegRNA-target DNA复合物在多种状态下的冷冻电镜结构。终止结构以及功能分析表明，M-MLV RT将逆转录延伸到预期位点之外，导致支架衍生的结合，从而在目标位点上引起不希望的编辑。对起始前、起始和延伸状态的结构比较表明，M-MLV RT在逆转录过程中相对于SpCas9保持一致的位置，而pegRNA合成的DNA杂化双链则沿着SpCas9表面建立。在结构见解的基础上，该研究合理地设计了pegRNA变体和先导编辑变体，其中M-MLV RT融合在SpCas9中。总的来说，该研究结果提供了对先导编辑逐步机制的结构性见解，并将为开发多功能先导编辑工具箱铺平道路。
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