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推文汇总

阿越就是我 医学和生信笔记 2023-06-15

关注公众号,发送R语言Python,获取学习资料!

  Stay hungry, stay foolish!   

目前已连续更新130+篇原创推文,涉及数据分析、数据可视化、医学统计学、机器学习、生物信息学、网络药理学、临床预测模型、meta分析等多个领域。做一个简单汇总,方便查找。

以下是部分主要内容汇总连接,点击相应题目即可跳转!

R语言和医学统计学


R和医学统计学



R语言和医学统计学系列(1):t检验

R语言和医学统计学系列(2):方差分析

R语言和医学统计学系列(3):卡方检验

R语言和医学统计学系列(4):秩和检验

R语言和医学统计学系列(5):多因素方差分析

R语言和医学统计学系列(6):重复测量方差分析

R语言和医学统计学系列(7):多元线性回归

R语言和医学统计学系列(8):logistic回归

R语言和医学统计学系列(9):多重检验

R语言和医学统计学系列(10):正态性和方差齐性检验

R语言和医学统计学系列(11):球形检验

R语言和医学统计学系列(12):双变量回归与相关

R语言tidy风格医学统计学

R语言tidy风格医学统计学02

R语言和医学统计学:非参数检验的补充

R语言多个变量同时进行t检验、方差分析等


R语言机器学习


R语言机器学习



mlr3:开篇

mlr3:基础使用

mlr3:模型评价

mlr3:模型比较

mlr3:超参数调优

mlr3:嵌套重抽样

mlr3:特征选择

mlr3:pipelines

mlr3:技术细节

mlr3:模型解释

mlr3实战:决策树和xgboost预测房价

应用预测建模:开篇

应用预测建模:过度拟合和模型调优

应用预测建模:衡量回归模型的效果


R语言数据分析

R语言缺失值探索的强大R包:naniar

R语言缺失值插补之simputation

R语言处理因子之forcats包介绍(1)

R语言处理因子之forcats包介绍(2)

R语言处理因子之forcats包介绍(3)

R语言处理因子之forcats包介绍(4)

长数据变为宽数据的7种情况!

数据变为长数据的5种情况!

长宽数据转换的特殊情况

2行代码重命名上百个列名!

使用lubridate处理日期时间

让R运算速度快100倍!!!

你的R再次提速!!!

正则表达式匹配中文

使用officeverse和Word、PPT进行交互


未完待续......

R语言可视化

热图系列:

超详细的R语言热图之complexheatmap系列1

超详细的R语言热图之complexheatmap系列2

超详细的R语言热图之complexheatmap系列3

超详细的R语言热图之complexheatmap系列4

超详细的R语言热图之complexheatmap系列5

超详细的R语言热图之complexheatmap系列6

超详细的R语言热图之complexheatmap系列07

超详细的R语言热图之complexheatmap系列8(完结篇)


森林图:

画一个好看的森林图

用更简单的方式画森林图

R语言画森林图系列3!

R语言画森林图系列4!

R语言画误差线的5种方法!!

               

韦恩图/upset plot:

简单的韦恩图画法

ggplot2版本的韦恩图画法

韦恩图进阶!upset plot 01

韦恩图进阶!upset plot 02

韦恩图进阶!upset plot 03

韦恩图进阶!upset plot 04


graphpad prism:

ggplot2变成Graphpad Prism样式:ggprism(01)

ggplot2变成Graphpad Prism样式:ggprism(02)

ggplot2变成Graphpad Prism样式:ggprism(03)

ggplot2变成Graphpad Prism样式:ggprims(04)

ggplot2变成Graphpad Prism样式:ggprims(05)

               

GGally:

ggpairs展示数据间的相关性

ggduo展示两组数据间的相关性

ggnostic和ggcoef可视化回归模型

GGally包的实用函数


corrplot包可视化相关矩阵详解

统计可视化的颜值天花板:ggstatsplot

R语言ggsci配色包详解

R语言ggtern包画三元图详解

让你的ggplot2支持markdown语法

让你的ggplot2主题支持markdown和css

R语言ggplot2画饼图及添加百分比标签

超详细教程:修改ggplot2图例

使用R语言美化PCA

R语言画dumbbell chart

R语言可视化聚类

R语言画好看的聚类

R语言可视化新冠疫情

使用ggplot2画一个五颜六色条形图

画一幅更好看的杠铃图

你还不会画网络图

通过数据看上海疫情

画一个好看的桑基图

可视化可爱的小蜜蜂

不等宽条形图


未完待续......

常见R包学习

R语言添加显著性标记之ggsignif

使用ggimage添加图片、图标、国旗等

使用scales自定义图形标签和刻度

让你的图片中文不再乱码!

转换国家代码的神奇R包!

今天你emo了吗?

使用compareGroups包1行代码生成基线资料表

使用skimr对数据进行描述性分析


未完待续......

生信学习

使用tinyarray简化你的TCGA分析流程!

使用tinyarray包简化你的GEO分析流程!

TCGA批量差异分析并可视化

R语言ggplot2画相关性热图

R语言生信表学习之网络图

机器学习算法识别结直肠癌中的免疫相关lncRNA signature

TCGA改版后转录组数据的下载以及整理

1万个基因批量wilcoxon检验?

lasso回归结果美化


未完待续......

R语言做网络药理学

R语言和网络药理学:批量处理ETCM的数据

未完结......

R语言meta分析

预计7月份开始更新......

临床预测模型

  • R语言画多时间点ROC和多指标ROC曲线

  • 逻辑回归、Cox回归、竞争风险模型、lasso回归、随机森林、支持向量机、xgboost等
  • 模型建立与评价
  • 自变量筛选方法
  • 列线图(nomogram)
  • 校准曲线(Calibration Curve)
  • 决策曲线(Decision Curve)
  • NRI(净重新分类指数)和IDI(综合判别改善指数)
  • ......

其他

使用zotero和obsidian管理和阅读文献

VScode中使用R语言

给你的RStudio换一个炫酷的主题吧!

OneNote支持Markdown:oneMark,重新定义OneNote

矿工日常:藏毛窦简介

R语言添加到环境变量中

我的个人博客上线了!


未完待续......

 


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欢迎在评论区留言或直接添加我的微信!

 
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